Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms