Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps28P62858 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms