Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms