Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms