Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms