Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms