Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp5eP56382 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms