Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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