Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PctpP53808 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PctpP53808 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PctpP53808 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PctpP53808 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms