Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpreP49446 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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