Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf7P43029 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms