Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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