Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprkP35822 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms