Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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