Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
U2af2P26369 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms