Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms