Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SftpcP21841 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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