Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms