Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms