Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprqP0C5E4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms