Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NefmP08553 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NefmP08553 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NefmP08553 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NefmP08553 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NefmP08553 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms