Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TtrP07309 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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