Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-Eb1P04230 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H2-Eb1P04230 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H2-Eb1P04230 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H2-Eb1P04230 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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