Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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