Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01755 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01755 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01755 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01755 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01755 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01755 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01755 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms