Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms