Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms