Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1bO55017 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms