Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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