Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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