Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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