Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms