Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms