Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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