Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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ApobE9Q414 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms