Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms