Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms