Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cspp1B2RX88 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms