Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms