Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palm3A2TJV2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms