Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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