Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17190V9GX38 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms