Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms