Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Padi3Q9Z184 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms