Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nme3Q9WV85 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms