Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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