Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms