Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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