Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms