Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms